Le 19 novembre 2020, le webinaire “Connaissez-vous vraiment vos fromages ? Voyage au cœur des écosystèmes microbiens.” a rassemblé 30 personnes pour une demi-journée de présentations et d’ateliers pédagogiques.

Coorganisé par CERAQ, l’AFTALP et l’ILS, cet évènement était une déclinaison locale d’un colloque organisé le 21 janvier 2020 par le RMT Fromages de Terroirs, à Paris.

Ils avaient pour objectif de faciliter l’appropriation des méthodes omiques par les filières fromagères de terroir, un travail mené dans le cadre du projet CASDAR Adamos (2019-2023), porté par CERAQ et soutenu par le RMT.

Les diaporamas des présentations et des ateliers sont téléchargeables :

• La présentation d’introduction sur les systèmes microbiens
• Le diaporama de l’atelier méthodes omiques
• Le diaporama de l’atelier biodiversité
• La présentation transversale des résultats des projets (« De l’herbe au fromage »)
• La présentation du projet Adamos

Si vous avez des questions au sujet de ce webinaire, vous pouvez vous adresser à blandine.polturat@ceraq.fr

Le 28 novembre 2023, la rencontre “Savoir-faire et microbiodiversité : de la ferme à des fromages de qualité” a rassemblé 78 personnes pour une demi-journée de présentations et une session poster à La Roche sur Foron (ENILV).

Coorganisé par CERAQ, l’AFTALP et l’ILS, cet évènement était une déclinaison locale d’un colloque organisé le 26 avril 2023 par le RMT Fromages de Terroirs, à Paris. Ces deux évènements ont pour objectif d’apporter de nouveaux éclairages sur les écosystèmes microbiens et de faciliter l’appropriation des méthodes omiques par les filières fromagères de terroir, un travail mené dans le cadre du projet CASDAR Adamos (2019-2023), porté par CERAQ et soutenu par le RMT.

Les diaporamas des présentations, les posters et les documents distribués le jour de la rencontre sont téléchargeables ci-dessous.

Si vous avez des questions au sujet de cette rencontre, vous pouvez vous adresser à blandine.polturat@ceraq.fr

Programme : 

• 2023_11_28_Programme

Présentations

Introduction

• 1 – Introduction aux écosystèmes microbiens – Sarah Chuzeville – ACTALIA
• 2 – Les méthodes méta-omiques – Eric Dugat-Bony – INRAE

Projet ADAMOS – Un nouveau regard sur les écosystèmes laitiers et fromagers

• 3.1 – Adamos – Présentation du projet – Blandine Polturat – CERAQ – Un nouveau regard sur les écosystèmes laitiers et fromagers
• 3.2  – Adamos – Bleu d’Auvergne – Celine Delbes – INRAE – Un nouveau regard sur le développement de l’amertume dans les fromages Bleu d’Auvergne et ses relations avec le microbiote du fromage.
• 3.3 – Adamos – Beaufort – Blandine Polturat – CERAQ – Un nouveau regard sur la diversité microbienne de ferments indigènes et leur influence sur les qualités organoleptiques des fromages Beaufort.
• 3.4 – Adamos – Comté – Yvette Bouton – CIGC – Un nouveau regard sur l’effet de la température de chauffage en cuve sur le microbiote et la qualité organoleptique du Comté.
• 3.5 – Adamos – Ressources – Cécile Charles – ENILV – Les ressources à disposition des acteurs des filières sur les écosystèmes microbiens et l’utilisation des méthodes omiques.

Autres projets

• 4 – Projet Litières – Blandine Polturat – CERAQ – Quelle influence des pratiques d’élevage sur les écosystèmes microbiens des fermes ?
• 5 – MetaPDOCheese – Celine Delbes – INRAE – Cartographie de la diversité microbienne des laits et des fromages AOP français et exploration des déterminants technologiques

Posters (cette section est en cours et sera complétée)

Microbiodiversité et transformation fromagère

• Adamos – Beaufort – Un nouveau regard sur la diversité microbienne de ferments indigènes et leur influence sur les qualités organoleptiques des fromages
• Adamos – Tome des Bauges – Evolution des microbiotes des laits et des fromages au cours du report du lait et de la fabrication de la Tome des Bauges
• Adamos – Tomme de Savoie – Quel effet des méthodes de maturation du lait sur les microbiotes du lait, des fromages et les qualités organoleptiques de la Tomme de Savoie ?
• Erasmo – Synergie des flores microbiennes et valorisation des potentialités du lait cru : exploration par métagénétique

Microbiodiversité des élevages

• Levures vivantes – Quelle est l’influence de la distribution de levures vivantes surles écosystèmes microbiens de l’environnement et du lait ?

[…]

Microbiodiversité et ferments 

[…]

Autres ressources distribuées

Livres 

• “Microflore des laits crus”, 2011, RMT Fromages de Terroir (pour en savoir plus)”Caractéristiques sensorielles des fromages : quelles influences des conditions de production du lait ?”, 2004 – Disponible sur demande

Fiches de synthèse de résultats 

• Erasmo – Synthèse des résultats – Synergie des flores microbiennes et valorisation des potentialités du lait cru : exploration par métagénétique
• Levures vivantes – Synthèse des résultats – Quelle est l’influence de la distribution de levures vivantes surles écosystèmes microbiens de l’environnement et du lait ?

Autres 

• Adamos – Présentation du projet  – Un nouveau regard sur les écosystèmes laitiers et fromagers

Le projet CASDAR Adamos, porté par Ceraq, vise à apporter aux filières fromagères de terroir un nouveau regard sur les écosystèmes microbiens des laits et des fromages, en leur rendant accessibles de nouvelles méthodes d’analyse du matériel génétique reposant sur le séquençage haut débit de fragments d’ADN et sur le séquençage de l’ARNm. Ces méthodes sont développées et testées afin de répondre aux questionnements des filières sur les écosystèmes microbiens des laits et des fromages. Retrouvez la plaquette de présentation du projet :

• Plaquette de présentation – ADAMOS

Le projet DOCaMEx a permis de construire une démarche permettant de capitaliser les savoir-faire et connaissances fromagères. Cette démarche comprend une méthode de recueil des savoir-faire, un moteur d’intégration et d’exploitation des données et une interface utilisateur, le moteur étant à paramétrer pour chacune des filières. Retrouvez ici la plaquette de présentation du projet.

• Plaquette de présentation du projet DOCaMEx

Le projet PEPIT Litières a pour objectif d’apporter aux filières fromagères de la région AURA une meilleure connaissance des écosystèmes microbiens des litières et d’étudier l’impact de certaines pratiques sur les microbiotes des litières et des laits.  Voici les livrables consultables à ce jour : 

Présentations

• Quelle influence des pratiques d’élevage sur les écosystèmes microbiens des fermes ? – Rencontre « Savoir-faire et microbiodiversité », 28 novembre 2023, La Roche sur Foron (ENILV)

Comptes rendus 

• Etat des lieux des pratiques de gestion des zones de couchage en Auvergne-Rhône-Alpes dans le contexte des filières fromagères AOP-IGP – Mémoire de fin d’études de Constance Fournier suite à son stage à CERAQ, 2022